Gemäß dem niederländischen Aktienrecht, dem die Navigator Equity Solutions SE als Europäische Aktiengesellschaft nach niederländischem Recht unterliegt, verfügt das Unternehmen über eine zweigeteilte Führungs- und Kontrollstruktur, die aktuell einen vierköpfigen Vorstand und einen dreiköpfigen Aufsichtsrat umfasst.